CH|EN

400 921 3918报告查询

首页 > 服务与产品 > 生命科学研究 >

单细胞转录组重测序

服务简介

单细胞转录组是指某个细胞在某一生理功能状态下所有转录的mRNA产物的集合,是基因组遗传信息传递和表达的重要步骤和过程。单细胞转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一单个细胞在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。转录组重测序针对的是有参考基因组的物种。与参考基因组比较,可以得到基因表达差异、可变剪接、融合基因等遗传调控信息。技术流程:单细胞裂解-MALBAC扩增-文库构建-高通量测序-数据处理-生物信息分析。


适应人群

生命科学研究工作者

检测优势

运用Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles, MALBAC多重退火环状循环扩增技术,精确反转录某一单个细胞在某一状态下的几乎所有转录本序列信息mRNA并进行扩增。解决了扩增对微量初始模板过大的扩增偏移,使得单细胞中90%的基因组能够被测序,样品起始量可低至0.5pg

无物种的限定;要求mRNAPoly A尾结构,GC%为35-65%。

分辨率高:单碱基分辨率;

覆盖度高:能覆盖到几乎所有转录本片段序列;

检测范围广:从几个到数十万个拷贝精确计数,可同时鉴定及定量正常和稀有转录本;

技术参数

样品要求样品类型:已分离的单细胞样本或去蛋白并进行DNase处理后的完整Total RNA

样品需求量(单次):使用MALBAC进行微量扩增,样品建议为单细胞或总量≥10pg,最低起始量≥0.5pg。

服务优势

亿康基因以MALBAC®为核心技术,搭建了国际领先的单细胞全基因组扩增及测序平台,分布在北京、上海、泰州等地区。平台拥有HiSeq 2500NextSeq 550MiSeqMiniSeq 等先进的设备仪器若干,经验丰富的实验技术人员80人次,技术服务团队标准化的实验操作和规范化的管理流程为广大科研工作者提供了高品质可重复性的实验结果,其技术成果已广泛应用于肿瘤,神经,生殖,干细胞及宏观基因组学研究领域。

产品简介

样品要求样品类型:已分离的单细胞样本或去蛋白并进行DNase处理后的完整Total RNA

样品需求量(单次):使用MALBAC进行微量扩增,样品建议为单细胞或总量≥10pg,最低起始量≥0.5pg

PE151:推荐数据量,6G clean data以上。

检测流程

每个样品数据量6G以下,样品量小于10个,标准流程的执行周期约为50 个工作日;

样品数量多于10个时,项目的执行周期需根据项目的规模而定。

项目合格指标产生不低于合同规定的clean data

信息分析标准信息分析:对原始数据去除接头序列、污染序列及低质量reads

测序数据统计;可结合客户的材料与需求,协商确定定制化信息分析内容。


成功案例

版权所有@ 亿康基因 2014-2015。保留一切权利。京icp备 16027446号-1